Der Kreistag wird durch den Kreistagspräsidenten Michael Stieber vertreten.

Der Kreistag wählte aus seiner Mitte Edgar Kliewe zum 1. Stellvertreter und Eckhardt Tabbert zum 2. Stellvertreter des Kreistagspräsidenten, die ihn im Verhinderungsfall vertreten.

Zur Unterstützung des Kreistagspräsidenten gehören neben den Stellvertretern weiterhin Karlo Schmettau und Prof. Dr. Werner Freigang zum Präsidium.

Gemäß der Kommunalverfassung des Landes Mecklenburg-Vorpommern können sich die Kreistagsmitglieder zu Fraktionen zusammenschließen oder bestehenden Fraktionen mit deren Zustimmung beitreten.

Eine Fraktion muss aus mindestens vier Mitgliedern bestehen. Ihre innere Ordnung muss demokratischen und rechtsstaatlichen Grundsätzen entsprechen.

Jeder Kreistag hat einen Kreisausschuss zu bilden. Diesem gehören laut Hauptsatzung des Landkreises Mecklenburgische Seenplatte 16 Mitglieder des Kreistages an. Der Landrat gehört dem Kreisausschuss als stimmberechtigter Vorsitzender an.

Die Sitzungen des Kreisausschusses sind laut Hauptsatzung öffentlich.

Der Kreistag kann zur Vorbereitung seiner Beschlüsse ständige oder zeitweilige Ausschüsse bilden, die beratend tätig werden.
Die Besetzung der Ausschüsse  erfolgt nach den Grundsätzen der Verhältniswahl. Nach der Neufassung der Hauptsatzung des Landkreises Mecklenburgische Seenplatte bildet der Kreistag Ausschüsse für folgende Aufgabenbereiche:

Haushalts- und Finanzausschuss 

• Finanz- und Haushaltsangelegenheiten 
• Vorbereitung und Begleitung der Haushaltsführung Liegenschaftsangelegenheiten 
• Beteiligungen  

Rechnungsprüfungsausschuss 

• Rechnungsprüfungswesen
• Sonderprüfungsberichte

Ausschuss für Wirtschaft, Tourismus und Kreisentwicklung

• kreis- und überregionale Planungsangelegenheiten
• Wirtschaftsförderung
• Tourismus
• Kreisbetriebe
• öffentlicher Personennahverkehr (ÖPNV) 
• Arbeitsmarktförderung

Ausschuss für Bau und Umwelt 

• Tief- und Hochbauangelegenheiten
• Bau- und Wohnungswesen
• Umweltschutz
• Abfallwirtschaft
• Immissionsschutz
• Denkmalpflege und Denkmalschutz

Ausschuss für Familie, Soziales und Gesundheit

• Allgemeines Sozialwesen
• Alten- und Krankenpflege
• Aufgaben des Gesundheits- und Krankenhauswesens
• Migranten, Vertriebene, Kriegsopferfürsorge, Aussiedler, Asylbewerber
• Angelegenheiten der Familien, Frauen und Gleichstellung
• Angelegenheiten der Senioren
• Angelegenheiten der Behinderten

Ausschuss für Bildung und Sport

• Schul- und sonstige Bildungsangelegenheiten, Schulverwaltung
• Musik – und Volkshochschulen
• Sportförderung
• Sportstättenförderung
• Sportstättenentwicklungsplanung
• Förderung der Übungsleiterinnen und Übungsleiter und des Ehrenamtes

Ausschuss für Kultur 

• Kulturpflege 
• Kulturentwicklung 
• Kulturförderung 
• Theater, Museen und Bibliotheken

Ausschuss für Ländlichen Raum und Landwirtschaft

• Forst und Fischerei
• Erneuerbare Energien
• Dorferneuerung
• Landwirtschaft
• Veterinär- und Lebensmittelüberwachung

Ausschuss für Ordnung, Sicherheit, Brand- und Katastrophenschutz

• Öffentliche Sicherheit und Ordnung
• Rechtsangelegenheiten
• Datenschutzangelegenheiten
• Brandschutz, Hilfeleistung, Rettungsdienst und Katastrophenschutz

Die ständigen Ausschüsse des Kreistages haben – soweit nichts anderes bestimmt ist – elf Mitglieder und tagen in öffentlicher Sitzung.

Der Kreistag bildet einen Jugendhilfeausschuss. Ihm gehören 15 stimmberechtigte Mitglieder, einschließlich des Vorsitzenden, an. Neun Mitglieder des Jugendhilfeausschusses müssen Mitglieder des Kreistages sein oder sie werden vom Kreistag gewählt. Diese müssen Frauen und Männer sein, die in der Jugendhilfe erfahren sind. Sechs Mitglieder des Jugendhilfeausschusses werden auf Vorschlag der im Bereich des öffentlichen Trägers wirkenden und anerkannten Träger der freien Jugendhilfe vom Kreistag gewählt. Der Jugendhilfeausschuss hat eine Geschäftsordnung beschlossen.

Als beratende Mitglieder gehören dem Jugendhilfeausschuss an:

• der Landrat oder ein von ihm bestellter Vertreter
• der Leiter der Verwaltung des Jugendamtes oder dessen Vertretung
• ein Richter des Jugend-, Vormundschafts- oder Familiengerichts, der von dem Präsidenten des zuständigen Landgerichtes bestellt wird
• ein Vertreter der Arbeitsverwaltung, der von der zuständigen örtlichen Stelle bestimmt wird
• ein Vertreter der Schulen, der von der zuständigen örtlichen Schulverwaltung bestimmt wird
• ein Vertreter der Polizei, der von der zuständigen örtlichen Stelle bestimmt wird

Der Jugendhilfeausschuss befasst sich mit allen Angelegenheiten der Jugendhilfe, insbesondere mit

1. der Äußerung aktueller Problemlagen junger Menschen und ihrer Familien sowie mit Anregungen und Vorschlägen für die Weiterentwicklung der Jugendhilfe
2. der Jugendplanung
3. der Förderung der freien Jugendhilfe.

Die Sitzungen des beschließenden Jugendhilfeausschusses sind laut Hauptsatzung öffentlich.